文档摘要

分子动力学模拟 理论框架 模拟要点 分子动力学（MD）在经典力场势能面上数值积分牛顿运动方程，生成体系随时间的轨迹。核心算法是 Verlet 族积分器，velocity-Verlet 同时输出位置与速度、时间可逆且能量守恒良好，是最常用的形式。积分步长受最快运动（键伸缩振动，周期约 10 飞秒）约束，原子级 MD 通常取 1 到 2 飞秒；若用 SHAKE/RATTLE 约束键长，可将步长放宽到 2 飞秒。 会员。《分子动力学模拟》收录于灏天文库文集《计算化学》，整理自「灏天文库」，提供技术教程、实践指南与问题解决方案，支持在线阅读、全文检索与知识沉淀，助力开发者系统化学习。本站整理收录，版权归原作者/开源协议所有。文档编号13662。

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来源：灏天文库

原文： https://aiknowledge.cn/collection/275-%E8%AE%A1%E7%AE%97%E5%8C%96%E5%AD%A6

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