第七章：系统发育与分类学

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第七章：系统发育与分类学 mermaid graph TD 数据源[分子序列或形态特征] --> 预处理[比对与筛选] 预处理 --> 方法选择[选择建树方法] 方法选择 --> 距离法[距离法: UPGMA, NJ] 方法选择 --> 简约法[简约法: 最少步数原则] 方法选择 --> 最大似然法[最大似然法: 概率最大化] 方法选择 --> 贝叶斯法[贝叶斯法: 后验概率采样] 距离法 --> 树输出[生成系统发育树] 简约法 --> 树输出最大似然法 --> 树输出贝叶斯法 --> 树输出树输出 --> 评估[自展检验与后验概率评估] 评估 --> 应用[用于分类或演化推断] mermaid graph LR 物种A[形态相似但基因差异大] --> 可能为隐存种[隐存种: