2.4 没有参考怎么拼:从头组装、N50 与基因注释


文档摘要

2.4 没有参考怎么拼:从头组装、N50 与基因注释 本节摘要:研究新物种时没有坐标系可用,只能自己造:把海量短读长或长读长拼成完整基因组。本节讲 de Bruijn 图怎么用 k-mer 把碎片拼起来、N50 怎么衡量拼装质量、拼完之后如何给基因组做注释。 从拼图说起 从头组装(de novo assembly)面对的处境像拼一幅巨大的拼图,而且没有盒子上的成品图。测序把基因组随机打断,每条读长是一个碎片;… 会员。《2.4 没有参考怎么拼:从头组装、N50 与基因注释》收录于灏天文库文集《生物信息学基础:基因组学、蛋白质组学与数据分析》,原作者/来源:灏天文库,整理自「灏天文库」,提供技术教程、实践指南与问题解决方案,支持在线阅读、全文检索与知识沉淀,助力开发者系统化学习。本站整理收录,版权归原作者/开源协议所有。

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