7.3 结构数据库与靶标三维建模(PDB、AlphaFold DB) 7.3 结构数据库与靶标三维建模(PDB、AlphaFold DB) 在现代药物发现的版图中,靶标识别与验证是决定研发成败的关键环节。而要深入理解一个潜在药物靶标的生物学功能,仅凭其序列信息远远不够——我们必须“看见”它。这里的“看见”,并非肉眼可视,而是通过解析其在原子尺度上的三维空间构象,揭示其动态行为、配体结合口袋、关键残基的空间排布以及与其他分子的相互作用界面。这正是结构生物学的核心使命,也是靶标三维建模技术崛起的根本动因。 进入21世纪以来,随着X射线晶体学、冷冻电子显微镜(cryo-EM)和核磁共振(NMR)等实验手段的进步,我们对蛋白质结构的认知实现了从“静态快照”到“动态全景”的跃迁。