7.1.3 分子动力学 (GROMACS, LAMMPS)

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7.1.3 分子动力学 (GROMACS, LAMMPS) 当LAMMPS在GPU上“假装”加速：一个被忽略的力场精度陷阱与三步诊断法你有没有过这样的时刻？凌晨两点，集群监控面板上GPU利用率稳稳停在98%，里进程正贪婪地吞着显存，而你的分子动力学模拟——那个跑了三天、耗掉20万核时的NPT系综——刚刚在第42.7 ns处猝然崩溃，报错只有冷冰冰的一行：不是内存溢出，不是文件IO失败，不是MPI通信超时。是“无效的能量/力”。像一记无声的耳光，打在所有信任GPU加速的工程师脸上。这不是Bug。这是警告。是LAMMPS在用最克制的方式告诉你：你正在用单精度浮点数，计算本该由双精度守护的物理量。