7.2.3 知识图谱驱动的代谢推理

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7.2.3 知识图谱驱动的代谢推理 7.2.3 知识图谱驱动的代谢推理在数据科学与人工智能深度融合的今天，生命科学领域的研究正经历一场静默而深刻的范式迁移。传统的“假设—实验—验证”循环，正逐步被“数据驱动—知识融合—智能推理”所补充甚至替代。其中，代谢通路作为细胞生命活动的核心枢纽，其复杂性、动态性和上下文依赖性，使得单纯依赖组学数据或静态数据库难以揭示其深层调控机制。而知识图谱（Knowledge Graph, KG）作为一种结构化、语义丰富的知识表示形式，恰好为代谢网络的建模与推理提供了理想载体。本文将深入探讨如何构建并利用知识图谱驱动的代谢推理系统，从实体对齐、关系抽取、图嵌入到路径推理，层层递进，聚焦于可落地的技术细节与工程实践。一、为何需要知识图谱？