3.1.1 种（Species）定义困境：生物学种 vs. 多相种 vs. 基因组种（ANI...

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3.1.1 种（Species）定义困境：生物学种 vs. 多相种 vs. 基因组种（ANI ≥95%；dDDH ≥70%）在微生物分类学的深水区航行，我们常以为“种”（Species）是个稳固的锚点——直到某天，你用ANI算法比对两株分离自同一土壤样本、表型几乎一致的Pseudomonas菌株，得到94.8%的相似度；而另一对来自不同大陆、生理生化谱截然不同的Streptomyces菌株，ANI却高达95.3%。那一刻，教科书里的“生物学种”定义像被潮水冲垮的沙堡，而实验室里刚跑完的dDDH实验报告单上赫然印着68.7%，离70%的物种阈值只差1.3个百分点——这1.3%，是继续保留在原种名下，还是提名为新种？