5.1.2 元素循环功能群：氨氧化古菌（AOA）vs. 氨氧化细菌（AOB）、反硝化菌群（n...

文档摘要

5.1.2 元素循环功能群：氨氧化古菌（AOA）vs. 氨氧化细菌（AOB）、反硝化菌群（nar/nir/nor/nos基因簇组合）在微生物生态功能解析的工程化实践中，我们常陷入一个看似优雅却暗藏陷阱的认知惯性：把16S rRNA基因序列相似度当作功能代理——仿佛只要OTU聚类到97%相似度，就能断言其氮转化能力旗鼓相当。可现实狠狠打了这个假设一记耳光：同一属的Nitrosomonas菌株，有的携带完整amoCAB操纵子，有的却缺失amoA启动子上游调控区；而远在古菌域的Nitrososphaera viennensis，其amoA基因拷贝数不足AOB的1/5，但单位细胞氨氧化速率却高出3倍。