7.2.1 “微生物种”的本体论地位:是自然实体还是人类认知工具? 在微生物组学的实验室里,深夜两点的测序仪仍在低鸣,Bioinformatician小陈盯着屏幕上那条长达12,847 bp的16S rRNA基因序列——它来自一株从深海热液口沉积物中分离的未培养细菌。BLAST比对显示:与已知种Thermodesulfovibrio yellowstonii的相似度为98.3%,ANI(Average Nucleotide Identity)值为89.7%,dDDH(digital DNA–DNA hybridization)预测值为42.1%。按照《国际原核生物系统学委员会》(ICSP)现行标准,这应当被划归为Thermodesulfovibrio属的一个新种。