2.2.1 核心分子标记选择：叶绿体（*matK*, *rbcL*, *trnL-F*）、核...
文档摘要
2.2.1 核心分子标记选择：叶绿体（matK, rbcL, trnL-F）、核糖体（18S, ITS）、线粒体（atp1）的分辨率比较 在分子系统学的现代实践中，我们早已告别了“随便挑个基因、跑个邻接树、发篇论文”的粗放时代。今天，一个可靠的系统发育假说，其根基不是发表速度，而是标记选择的理性、数据生成的可控性、比对策略的可复现性、模型选择的可验证性——而这四者，无一不始于对核心分子标记的清醒判断。你手里的那条 matK 序列，不是一段随机字符串；它是一把刻度精密的尺子，但尺子本身有分辨率极限，也有测量盲区。选错了尺子，再精巧的建树算法，也只是在错误的刻度上反复校准零点。
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