6.1.2 系统发生物种概念(PSC):单系最小分支的阈值设定争议


文档摘要

6.1.2 系统发生物种概念(PSC):单系最小分支的阈值设定争议 在系统发生学物种界定的工程实践中,“单系最小分支”从来不是一张静态快照,而是一场在数据噪声、模型偏差与生物现实之间持续校准的动态平衡术。当你打开一份由数百个线粒体COI序列构建的贝叶斯系统树,用FigTree放大到某个看似“干净”的末端聚类——三株来自云南哀牢山、两株采自广西十万大山的Ficus microcarpa样本紧密成簇,支持率98%,分支长度0.0032;而它们与邻近支系(同属但不同种的F. virens)之间的分化距离是0.0176——此时,一个真正棘手的技术问题浮出水面:这个簇是否构成一个PSC意义上的“物种”? 不是哲学思辨,不是文献综述,而是——你手中的 命令该加哪个阈值参数? 还是 ?


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