2.1.1 配分函数与自由能

文档摘要

2.1.1 配分函数与自由能在计算物理与分子模拟的工程实践中，配分函数从来不是教科书里那个优雅却遥远的积分符号——它是你凌晨三点调试失败的蒙特卡洛采样链里悄然崩塌的归一化常数；是你在GPU集群上提交的LAMMPS作业中，因自由能差值偏差超0.5 kcal/mol而被审稿人一票否决的核心瓶颈；更是你在药物设计平台中为一个激酶抑制剂预测结合自由能时，必须跨越的、横亘在微观构象统计与宏观热力学测量之间的那道窄桥。我们不谈“配分函数是系综理论的生成函数”这种定义式陈述。我们要动手——拆解它、离散化它、截断它、近似它、并行化它；