3.1.1 映射算法（Mapping Algorithms）

文档摘要

3.1.1 映射算法（Mapping Algorithms）在DNA数据存储的工程实践中，编码层（Encoding Layer）绝非一个抽象的理论模块——它是比特与碱基之间第一道、也是最不可妥协的转换闸门。当一串二进制流抵达合成仪入口前，它必须被翻译成A、C、G、T这四个化学符号构成的寡核苷酸序列；而这一翻译过程，不是查表，不是拼接，而是一场精密的、可逆的、抗错的、化学友好的信息重铸。3.1.1节所聚焦的“映射算法”，正是这场重铸的核心引擎。它不处理纠错码的冗余插入，也不决定读长或片段重叠策略；它的任务更基础、更锋利：如何把0和1，稳稳地、高效地、均衡地，锚定到四个碱基的化学现实之上？这不是一个“选哪个映射表更快”的问题，而是一个系统性权衡：信息密度 vs.