2.1.2.1 范德华力:伦纳德-琼斯 (Lennard-Jones) 势


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2.1.2.1 范德华力:伦纳德-琼斯 (Lennard-Jones) 势 2.1.2.1 范德华力:伦纳德-琼斯(Lennard-Jones)势——工程师手记:当 $ \varepsilon $ 和 $ \sigma $ 在GPU上“失联”时,我们真正该调的不是参数,而是内存对齐方式 你有没有在某个凌晨三点,盯着分子动力学模拟中突然炸开的体系能量曲线发呆? 明明力场参数照着CHARMM或OPLS-AA手册逐字抄写,$ \varepsilon = 0.1094\,\text{kJ/mol} $、$ \sigma = 3.40\,\text{Å} $,连小数点后四位都核对过三遍; 明明邻接表构建无误,截断半径设为 $ r{\text{cut}} = 12.


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