2.2.2 联合原子力场 (United-Atom)：GROMOS

文档摘要

2.2.2 联合原子力场 (United-Atom)：GROMOS 在分子动力学模拟的精密世界里，力场不是一张静态的“地图”，而是一套实时演算的“物理宪法”——它定义原子如何呼吸、键如何伸缩、二面角如何扭转、范德华力如何低语、静电如何缠绕。当我们将目光投向脂质双层、烷烃链、环己烷团簇这类富含饱和碳氢结构的体系时，一个尖锐的问题浮现：是否必须为每一个氢原子单独赋予质量、电荷与Lennard-Jones参数？若答案是肯定的，那么对一条含20个亚甲基的正二十烷（n-eicosane），我们将不得不显式建模60个C–H键、40个H–C–H角、以及数百个H···H非键相互作用——计算开销陡增，采样效率断崖式下跌；