3.2.2 常用控温器：Berendsen, Bussi (V-rescale), Nosé...

文档摘要

3.2.2 常用控温器：Berendsen, Bussi (V-rescale), Nosé-Hoover 在分子动力学（MD）模拟的浩瀚星图中，温度绝非一个静默的背景参数——它是系统能量涨落的脉搏、相变发生的门槛、构象采样的节拍器，更是连接微观原子运动与宏观热力学可观测量的核心枢纽。当我们把一盒水分子投入NVT系综的模拟容器，真正要问的从来不是“温度设为300 K就行了吗？”，而是：我们究竟用什么机制去‘握住’这团不断碰撞、拉伸、旋转的原子云，让它的动能分布稳定在目标值附近，又不扭曲其内在的动力学真实性？这个“握住”的动作，就是控温器（Thermostat）的使命；而它握得有多稳、多轻、多自然，直接决定了模拟结果是通向物理真相的窄门，还是滑入人为 artifacts 的歧路。