1.1.1.2 化学空间 (Chemical Space) 的概念与维度

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1.1.1.2 化学空间 (Chemical Space) 的概念与维度 1.1.1.2 化学空间（Chemical Space）的概念与维度：当“维度爆炸”撞上“指纹坍缩”——一个被低估的分子表征陷阱与它的实时解法你有没有在凌晨两点盯着屏幕上那条骤然崩塌的t-SNE散点图发呆？ ——明明输入了5000个结构迥异的类药分子，嵌入向量也规整得像军训方阵，可降维可视化后，92%的点却挤在右下角那个直径不到0.3的灰斑里。其余8%？散落在远处，孤零零，像被流放的星尘。你重跑RDKit指纹、换ECFP4、试MACCS、切Morgan半径、调 → → ……结果只是让灰斑微微胀大0.07个欧氏单位。你查日志，没报错；看内存，够用；问同事，他说“ECFP本来就这样”。