2.1.1.1 语法规则与规范化 (Canonicalization)

文档摘要

2.1.1.1 语法规则与规范化 (Canonicalization) 2.1.1.1 语法规则与规范化（Canonicalization）：当SMILES“看起来一样”，却在图同构判定中彻底失联——一个被低估的原子排序陷阱与RDKIT中底层行为的硬核解剖你有没有遇到过这样的场景？两行看似一模一样的SMILES字符串：和，在你写的分子相似性脚本里，被算出完全不同的指纹；在你构建的分子数据库中，它们被存为两条独立记录，哪怕你加了唯一索引；更诡异的是，当你用处理后，一个返回，另一个竟也返回 ——但你的原始输入明明是。你皱眉，重跑一遍，结果不变。你查文档，发现RDKIT说：“ 保证唯一性。” 你信了。