2.2.1 分子图 (Molecular Graph) 理论基础

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2.2.1 分子图 (Molecular Graph) 理论基础在化学信息学与人工智能交叉的最前沿，分子图（Molecular Graph）早已不是教科书里静止的碳骨架示意图——它是一套可计算、可微分、可嵌入的结构化数据协议，是连接原子物理本质与机器学习黑箱之间那根最精密、最不容妥协的“数据光纤”。你手头那串SMILES字符串，那张RDKit渲染出的二维结构图，甚至量子化学计算中输出的XYZ坐标，若未经图论语义的严格编码与拓扑归一化，就永远只是“待处理的原始信号”，而非“可建模的图结构张量”。