5.2.1 层次聚类与 K-means 聚类

文档摘要

5.2.1 层次聚类与 K-means 聚类在药物发现的浩瀚星图中，化学空间不是一张静止的地图，而是一片不断涌动、折叠、分形生长的高维海洋。分子并非散落于真空中的孤立点；它们彼此间隐秘地牵连着——相似的拓扑结构、相近的电子分布、可比的溶解行为，让成千上万的化合物天然聚集成若干“分子群岛”。若我们盲目采样，就像在太平洋上随机抛下十根钓竿，指望捕获全部鱼群；而聚类，正是为这片海洋绘制第一张动态海流图谱的技术：它不预设岛屿形状，却能揭示哪些分子该被归入同一片生态位，哪些应被划为边缘孤岛，哪些则根本属于另一片洋盆。这便是5.2.1 层次聚类与 K-means 聚类的真正使命——不是给分子贴标签，而是为化学空间建立可导航、可干预、可泛化的结构骨架。