7.2.1.2 打分函数 (Scoring Functions):基于力场、基于经验、基于知识 7.2.1.2 打分函数(Scoring Functions):当经验公式在真实口袋里“失重”——一个被忽略的氢键方向性校正实战手记 你有没有过这样的时刻? 分子对接跑完了,打分排名前五的配体,晶体结构一比对——三个根本没进结合口袋,一个卡在溶剂通道口像被门框卡住的快递员,还有一个,其预测结合构象与实验中X射线解析的pose RMSD高达4.8 Å,但它的AutoDock Vina打分却高居榜首,比真正活性分子还低0.9 kcal/mol。 你盯着终端里那一行绿色的 ,心里却浮起一句冰冷的质问: 这个数字,到底是在给结合强度打分,还是在给力场参数和训练数据偏差联合出演的默剧鼓掌?