1.3.2 实验设计相关：Doublets (双细胞), Sparsity (稀疏性), D...

文档摘要

1.3.2 实验设计相关：Doublets (双细胞), Sparsity (稀疏性), Dropout (掉靶) 在单细胞转录组学的实验设计与数据分析链条中，Doublets（双细胞）、Sparsity（稀疏性）、Dropout（掉靶）这三个术语绝非教科书里轻描淡写的注脚——它们是悬在每一个scRNA-seq项目头顶的三把达摩克利斯之剑。你可能已经成功完成了10× Genomics Chromium建库、获得了百万级reads、跑通了CellRanger流程、甚至用Seurat完成了初步聚类……但若对这三个概念仅停留在“听说过”的层面，那么你眼中的UMAP图，很可能是一幅被系统性噪声扭曲的幻象；你标注的“新亚群”，或许只是两个细胞偶然挤进同一微滴后留下的嵌合体指纹；