2.1.1 组织获取与保存：新鲜组织 vs. 冻存组织 vs. FFPE

文档摘要

2.1.1 组织获取与保存：新鲜组织 vs. 冻存组织 vs. FFPE 在单细胞组学的宏大叙事里，样本准备从来不是序章，而是决定整部剧终局的伏笔。你见过多少次——流式分选完美、10x Genomics文库构建高效、Seurat聚类轮廓清晰，却在UMAP图上发现一批细胞诡异地聚集在右下角，表达谱既不像T细胞也不像成纤维细胞，更像被揉皱又摊开的滤纸？我见过。三次。最后一次，我们回溯到组织离体后的第47分钟：那块看似“新鲜”的肝癌组织，在冰上静置过久，表面已悄然启动冷缺血应激反应（cold ischemia stress），$HSP70$、$FOS$、$JUNB$ 的mRNA半衰期被压缩至不足15分钟，而核糖体亚基开始解离，$RPL13A$ 与 $RPS27L$ 的转录本丰度比值从1.