3.4.2 自动化注释工具：SingleR, Azimuth, CellTypist

文档摘要

3.4.2 自动化注释工具：SingleR, Azimuth, CellTypist 在单细胞转录组分析的浩瀚星图中，细胞类型鉴定与注释从来不是终点，而是真正生物学解释的起点。当我们从降维聚类的散点云中辨认出若干簇群，那些沉默的、未命名的“Cluster 0”到“Cluster 12”，就像未经破译的古卷——结构清晰，语义混沌。此时，自动化注释工具便不再是锦上添花的插件，而是一把淬火于参考数据、校准于统计原理、锋刃直指生物学本质的解码匕首。SingleR、Azimuth、CellTypist，这三者并非并列的“选项”，而是三种不同范式在细胞身份映射战场上的具象化投射：一个以无监督相似性投票为矛，一个以有监督迁移学习为盾，一个以轻量级深度决策树集成为弓。