3.4.3 细胞本体论（Cell Ontology）的应用

文档摘要

3.4.3 细胞本体论（Cell Ontology）的应用在单细胞转录组分析的浩瀚数据海洋中，我们常被一个看似朴素却直击灵魂的问题所围困：这个簇，到底是什么细胞？不是“看起来像什么”，而是“它在生物学意义上究竟属于哪一类定义明确、可复现、可交流、可计算的细胞实体？”——这绝非一句主观判断所能承载。当UMAP图上十几个颜色斑斓的簇跃然眼前，当差异表达基因列表密密麻麻铺满屏幕，真正的挑战才刚刚开始：如何将高维空间中的数学聚类，锚定到百年来实验生物学反复验证、解剖学与功能学双重支撑、发育谱系清晰可溯的细胞身份坐标系上？答案不在统计模型里，而在细胞本体论（Cell Ontology, CL）这一被精心锻造的语义骨架之中。