4.2.1 配体-受体相互作用数据库：CellPhoneDB, CellChat

文档摘要

4.2.1 配体-受体相互作用数据库：CellPhoneDB, CellChat 在单细胞转录组学的浩瀚星图中，细胞从来不是孤岛——它们通过精密编织的分子信使网络持续对话、协商、协同与制衡。当我们从高维基因表达矩阵中解码出细胞类型、状态与轨迹之后，一个更本质的问题便浮出水面：这些被标注为“Treg”、“M2巨噬”或“肿瘤相关成纤维细胞”的群体，究竟在组织微环境中向谁发送了什么信号？又接收了哪些指令？这不是简单的共表达分析，而是一场跨越细胞膜边界的、由配体（ligand）与受体（receptor）介导的、具有方向性、特异性与功能语义的分子外交。CellPhoneDB 与 CellChat 正是为此而生的两套“细胞语言翻译器”——但它们绝非黑箱工具；