4.4.2 通路富集：GSEA, GSVA, Metascape

文档摘要

4.4.2 通路富集：GSEA, GSVA, Metascape 在高通量转录组分析的纵深地带，差异表达只是故事的序章；真正的生物学洞见，往往蛰伏于基因集合的协同扰动之中——那不是单个基因的孤勇呐喊，而是通路层面的集体回响。当DESeq2或limma输出的差异基因列表被反复审视、排序、筛选之后，一个更本质的问题浮出水面：这些上下调基因，是否系统性地聚集在特定的生物学过程中？它们是零散散落的星火，还是已然汇成燎原之势的洪流？这正是通路富集分析所要回答的核心命题。