5.2.3 空间数据与单细胞数据的整合(Deconvolution)


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5.2.3 空间数据与单细胞数据的整合(Deconvolution) 5.2.3 空间数据与单细胞数据的整合(Deconvolution):从像素到细胞类型的可解释映射实践指南 你有没有站在显微镜前,凝视一张空间转录组切片——那些密密麻麻、色彩斑斓的spot,每个都像一枚微型生物传感器,记录着数百个基因在组织原位的表达强度?但它们不是细胞,而是直径50–100 μm的捕获区域,平均覆盖3–15个细胞。你手头却有一套高分辨率的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据:两万多个细胞,精细注释到亚型、状态、发育轨迹……可这两套数据之间,横亘着一道“尺度鸿沟”——前者是空间约束下的混合信号,后者是无空间信息的纯细胞类型谱。


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