2.1.2.1 传统类群：泉古菌门（Crenarchaeota）、广古菌门（Euryarch...

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2.1.2.1 传统类群：泉古菌门（Crenarchaeota）、广古菌门（Euryarchaeota）功能分化当16S rRNA引物在古菌群落中“失明”：一个泉古菌门Crenarchaeota与广古菌门Euryarchaeota功能分化解析的实战突围你有没有遇到过这样的场景？在厌氧消化反应器的宏基因组样本中，qPCR显示总古菌丰度高达$10^8$ copies/g TS，但16S rRNA扩增子测序（V4区）结果却显示古菌序列占比不足0.3%——几乎被细菌信号彻底淹没。Bioinformatician说“数据质量没问题”，微生物学家皱眉：“这不可能，氨氧化古菌（AOA）明明是主导硝化者。