7.1 硬件加速技术

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7.1 硬件加速技术第七章高性能计算优化与并行架构 7.1 硬件加速技术：分子动力学模拟的“算力透镜” 当我们站在GROMACS这一分子动力学（Molecular Dynamics, MD）模拟引擎的宏观视域回望，会发现一个令人震撼的事实：一个包含百万原子的蛋白质-配体复合体系，在常规时间步长 $ \Delta t = 2\,\text{fs} $ 下完成 $ 1\,\mu\text{s} $ 的采样，需执行 5×10⁸次力场计算迭代；